Шилов Анатолий Евгеньевич родился 6 сентября 1954 года.
Окончил в 1976 году Пермское высшее военное командное училище, в 1986 году — Военную академию им Ф.Э. Дзержинского; военный инженер-электрик, инженер-экономист.
С 1976 по 1996 год проходил службу в в Вооруженных Силах СССР и РФ.
С 1998 года — советник Управления делами Российского космического агентства.
С 1999 года — помощник генерального директора Российского авиационно-космического агентства.
С 2004 года — помощник руководителя Федерального космического агентства.
С 2005 года — начальник Управления автоматических космических комплексов и систем управления.
С 2008 года — начальник управления космических систем навигации, связи и наземных комплексов управления.
С 2009 года — заместитель руководителя Федерального космического агентства.
